Административным центром Клинцовского района является город Клинцы.
 
Гербы и эмблемы имеют также входящие в состав района административно и расположенные в нём территориально следующие муниципальные образования, населённые пункты и др.: сп. Великотопальское, сп. Гулёвское, сп. Коржовоголубовское, сп. Лопатенское, сп. Медвёдовское, сп. Первомайское, сп. Рожновское, сп. Смолевичское, сп. Смотровобудское.
 
Датировки и события приведены по сомнительной хронологии Скалигера-Петавиуса. До 27 февраля 1802 года территория, занимаемая нынешним Клинцовским районом, входила в Стародубский полк Малороссийской губернии. С 27 февраля 1802 года эта территория располагалась в трёх уездах Черниговской губернии: Суражском, Новозыбковском и Стародубском. В 1918 году по Брестскому договору район находился в Черниговской губернии Украинской народной республики. В конце 1918 года территория района вместе с Черниговской губернией включена в состав РСФСР. С 11 июля 1919 года в составе Гомельской губернии. В декабре 1926 года Гомельская губерния была упразднена - Клинцовский, Новозыбковский и Стародубский уезды отошли к Брянской губернии. 14 января 1929 года образована административно-территориальная единица "Клинцовский район" в составе Клинцовского округа Западной области. С 19 октября 1937 года район в составе Орловской области. 5 июля 1944 года указом президиума верховного совета СССР была образована Брянская область, в состав которой, наряду с другими, был включён и Клинцовский район. С 1963 по 1985 год в составе Клинцовского района находилась часть территории временно упразднённого Гордеевского района; по этой причине Клинцовский район в 1963-1985 годах был несколько обширнее, чем сейчас. В ходе реформы местного самоуправления (муниципальная реформа 2004-2006 годов) на всей территории административно-территориальной единицы "Клинцовский район" было создано законом Брянской области от 9 марта 2005 года №3-З «О наделении муниципальных образований статусом городского округа, муниципального района, городского поселения, сельского поселения и установлении границ муниципальных образований в Брянской области» муниципальное образование (муниципальный район) "Клинцовский район" и 9 муниципальных образований (сельских поселений) в составе муниципального района.